Au printemps et en été, le site accueille jusqu’à 18 espèces nicheuses, réparties d’un bout à l’autre du Sillon de Talbert et dans les îlots situés à son extrémité. Citons pour exemple, le Grand gravelot et le Gravelot à collier interrompu, dont les œufs sont disposés directement au sol parmi le sable et les galets, dans les zones non recouvertes par la marée.

Deux espèces de sternes (Sterne naine et Sterne pierregarin) ainsi que l'Huîtrier pie sont aussi des oiseaux nicheurs de ces milieux.

Dans le milieu dunaire on rencontre quatre espèces de passereaux dont les nids sont dissimulés dans la végétation : l’Alouette des champs, le Pipit farlouse, le Tarier pâtre et la Cisticole des joncs.

La Réserve naturelle possède une responsabilité régionale majeure et très élevée pour 8 de ces espèces nicheuses (Grand gravelot, Cormoran Huppé, Goéland argenté, Gravelot à collier interrompu, Huîtrier pie, Pipit maritime et Tadorne de Belon).

De passage ou en hivernage, la Réserve naturelle constitue un point d’accueil favorable pour de nombreuses espèces d’oiseaux. Ainsi, des effectifs importants de limicoles, tels que les Bécasseaux, les Pluviers ou encore les Gravelots, se concentrent à marée basse dans les milieux de vases et de prés salés en quête d’invertébrés. La Bernache cravant, petite oie de Sibérie, fréquente quant à elle les herbiers de zostères pour se nourrir. Les laisses de mer échouées sur la plage sont également prospectées, notamment par les Tournepierres à collier. A marée haute, grèbes, plongeons et harles, plongent à la recherche de nourriture tandis que les limicoles trouvent refuge sur les zones hors d’eau telles que le Sillon, l’île Blanche et quelques écueils rocheux. Plusieurs espèces de passereaux fréquentent également le site à la saison mauvaise, des plus communes comme la Linotte mélodieuse, le Verdier d’Europe à certaines plus rares, comme le Bruant des neiges qui revient sur le site chaque hiver.